网站设计公司和互联网广告公司在职能上有所不同，其区别主要体现在以下几个方面：目标、服务内容、工作方式和技术要求。

一、目标不同 网站设计公司的主要目标是为客户设计和制作独特和功能强大的网站。他们的主要关注点是网站的用户体验、可用性和视觉设计等方面。网站设计公司主要注重网站的技术搭建和界面设计，并提供用户友好的功能和内容。

互联网广告公司的主要目标是帮助客户将产品或服务通过互联网广告形式推广出去，提升品牌知名度和销售量。他们的主要关注点是广告投放渠道、目标受众、广告效果监测等方面。互联网广告公司主要注重广告创意、投放策略和数据分析等内容。

二、服务内容不同 网站设计公司的主要服务内容包括网站策划、界面设计、编码开发、前后端技术支持、内容管理系统建设等。他们会与客户合作，根据客户需求设计和开发符合其业务需求的网站。

互联网广告公司主要服务内容包括广告策划、创意设计、投放渠道选择、广告素材制作、广告效果监测等。他们会与客户合作，根据市场需求和目标受众，制定相应的广告计划，并对广告效果进行科学监测和分析。

三、工作方式不同 网站设计公司的工作方式与客户的合作相对密切，需要与客户进行多次沟通和碰头，以确保网站的设计和功能符合客户的要求。这是一个比较亲近客户的过程。

互联网广告公司的工作方式相对独立，需要根据客户的要求进行媒体购买、广告投放和效果分析等工作。他们与客户的接触相对较少，更多的是与广告平台和供应商合作。

四、技术要求不同 网站设计公司需要具备一定的网站开发技术以及设计能力，熟悉HTML、CSS、JavaScript等前端技术和PHP、Java等后端技术。他们还需要了解网页设计、用户体验、交互设计等相关知识。

互联网广告公司需要具备一定的市场策划和创意设计能力，熟悉互联网广告平台和工具的使用。他们还需要了解市场营销、品牌定位、目标受众心理等相关知识。

总结起来，网站设计公司更注重网站的技术和设计，以满足客户的需求；而互联网广告公司更注重广告的创意和投放效果，以帮助客户提升品牌知名度和销售量。它们在目标、服务内容、工作方式和技术要求等方面存在明显的差异。